OCV_と付くプラグインは、最初にOCV__LoadLibraryを実行し、opencv_java***.dllをロードしてから使用します。
各プラグインのパラメータは、OpenCVの関数の引数に準拠しています。
OpenCVのサイトのドキュメントを参考にしてください。
以下はバイラテラルフィルタの例です。
（左がOpenCVのサイトのドキュメント、右がプラグインのダイアログです）
場合によっては、「プレビュー」、「ROIマネージャへのROIの追加」、「結果のテーブルの更新」などの可否を指定できる場合もあります。